河流水系 内蒙古自治区共九大水系，分别为大兴安岭西麓黑龙江水系地区，呼伦贝尔高平原内陆水系地区，大兴安岭东麓山地丘陵嫩江水系地区，西辽河平原辽河水系地区，阴山北麓内蒙古高平原内陆水系地区，阴山山地、海河、滦河水系地区，阴山南麓河套平原黄河水系地区，鄂尔多斯高平原水系地区，西部荒漠内陆水系地区。

根据第一次全国水利普查成果，我区流域面积50平方公里及以上的河流总数为4087条，河流的总长度为14.48万公里。水面面积在1平方公里及以上的湖泊总数为428个，水面总面积3915.9平方公里。黄河从宁蒙界都思兔河黄河汇入口流入内蒙古，干流流经阿拉善盟、乌海市、鄂尔多斯市、巴彦淖尔市、包头市、呼和浩特市6个盟（市）的18个旗（县、区），于呼和浩特市清水河县老牛湾出境进入山西省境内，我区干流长843.5公里、流域面积15.19万平方公里。

水资源量 根据自治区第三次水资源调查评价成果，全区多年平均自产水资源总量515.72亿立方米，其中地表水资源量370.03亿立方米，地下水资源量217.83亿立方米，地下水与地表水资源量重复量为72.14亿立方米；2025年全区自产水资源总量562.61亿立方米，其中地表水资源量394.32亿立方米，地下水资源量247.95亿立方米，地下水与地表水资源量重复量为79.66亿立方米。

人均水资源量和单位面积耕地水资源量  2025年，全区年人均占有水量2370立方米，每公顷实灌耕地平均占有水量1.21万立方米。水资源与人口和耕地分布不协调，其中松花江流域总面积占全区的27.1%，耕地实灌面积占全区的12.7%，人口占全区的15.4%，而水资源总量占全区的61.9%，人均占有水资源量为全区均值的4.0倍；辽河、海河、黄河 3个流域总面积占全区的26.1%，耕地实灌面积占全区的80.2%，人口占全区的74.1%，但水资源仅占全区28.2%，大部分地区水资源紧缺。

地表水分布特征  2025年，全区地表水资源量比2024年减少1.4%，比多年平均偏多6.6%。全区地表水资源空间分布不均，局部地区水量富而有余，而大部分地区干旱缺水。东部地区各河流年径流量最大与最小的比值在4～12之间，中部地区各河流在6～22之间，西部地区部分河流高达26以上。河川径流年内分布不均，6～9月是降水最为集中的季节，也是形成径流的高峰期，径流量约占全区径流量的60～80%。最大月径流量一般发生在7～8月份。

地下水分布特征  2025年，全区地下水资源量比2024年减少4.6%，比多年平均偏多13.8%。全区地下水资源普遍具有平原区多、山丘区少和内陆河流域更少的特点。平原区地下水资源模数3.61万立方米/平方公里，是山丘区的2.0倍。